С какими продуктами чаще всего используют MirOB

Заглянул на страницу плагина MirOB в отличном проекте BioGPS. Там есть такая графа: "Наиболее часто используется с" (или "С этим продуктом обычно смотрят").

Вот три проекта, которые показываются с MirOB:

Неплохая компания подобралась, но наш продукт будет лучше. Недавно копались в Pathway Commons: визуализации их карт очень трудна для восприятия. Реактом по прежнему хорош, т.к. почти нечем его заменить. WikiPathways, тут получается, что я часто сверяю конкретные сигнальные пути не по их базе, а скорее по базам крупных фармацевтических и биотехнлогических компаний, у них сейчас подобные карты лучше представлены. Хотя, несколько источников всегда лучше одного.

А вот наша страница на omictools показывает следующие проекты, похожие с MirOB:

  • NsRRR — A multivariate regression model capable of using prior biological knowledge expressed as gene...

  • AraPath — A knowledgebase for pathway analysis in Arabidopsis. To create a knowledgebase for plant pathway...

  • Comparison of human cell signaling pathway databases-evolution, drawbacks and challenges — Authors: Chowdhury, S., and Sarkar, R.R. Abstract: Elucidating the complexities of cell...

  • SpliceNet — A method to infer isoform-specific co-expression networks from exon-level RNA-Seq data, using...

  • iPathwayGuide — Allows users to quickly visualize their data through these analyses: gene analysis, gene...

  • Moksiskaan — A computational platform that can be used to integrate information about the connections between...

  • PathwayGuide — It is the most advanced standalone pathway analysis application available. Similar to...

  • PathJam — A public tool which provides an intuitive and user-friendly framework for biological pathway...

  • CellNOpt — A software tool used for creating logic-based models of signal transduction networks using...

  • PathCards — An integrated database of human biological pathways and their annotations. Human pathways were...

  • SignaLink — A signaling pathway resource with multi-layered regulatory networks. Users can effectively...

  • PATHiWAYS — A web tool for the interpretation of the consequences of the combined changes in expression...


Info

Union Genes (
)
:
Order:

Set 1 unique genes (
)
:
Order:

Set 2 unique genes (
)
:
Order:
Drugs and Targets there..
Oncosupressions microRNA chart there..
Oncogenic microRNA chart there..
graphviz test: