Roadmap


На этой странице собраны наши планы (roadmap) и задачи на ближайшее будущее.

Планы:

  • Интеграция Cytoscape.js и/или собственного движка на d3.js для визуализации генных сетей. (Сейчас используется Cytoscape Web)

  • Новые алгоритмы поиска кратчайших путей.

  • Иерархическая приоритезация данных (фильтры) для лучшей и более наглядной визуализации данных.

  • Новые алгоритмы построения сигнальных каскадов и рассчет их вклада в развитие патогенетических процессов.

  • Сравнение датасетов с различным уровнем генной экспрессии у людей с заболеванием и без.

  • Анализ данных с микрочипов.

  • Анализ данных RNAseq.

  • Фильтры по тканям для построения генных сетей.

  • Сбор данных из сторонних открытых баз данных для построения дополнительного слоя генной сети. Базы данных: PID, biocarta, biogrid, Bind, Pazar, Kegg, Innatedb, Intact, DIP, HPRD, Wikipathways, Mint и многие другие.



__
У нас много различных экспериментальных модулей, которые не используются в публичной версии, но которые мы используем в своих исследованиях. По мере использования мы интегрируем популярные модули в публичную версию.

Пожалуйста, помогите нам в поиске ошибок и затруднений. Смело пишите нам любые жалобы, наезды, хвальбы, предложения через эту форму.


Info

Union Genes (
)
:
Order:

Set 1 unique genes (
)
:
Order:

Set 2 unique genes (
)
:
Order:
Drugs and Targets there..
Oncosupressions microRNA chart there..
Oncogenic microRNA chart there..
graphviz test: